男人包皮过长危害很多，不仅会影响房事，也会影响日常工作生活，甚至会造成阴茎疾病。
包皮过长会影响房事和谐。成年男人会由于包皮过长或包茎，影响正常房事。是包皮口径过小的男人，包皮上翻不能复原。阴茎勃起后，包皮紧紧卡在冠状沟处，成嵌顿包茎，痛苦不堪。情况严重时，龟头会因局部血流不畅而发生水肿，甚至可发生龟头坏死。另外，包皮包茎会影响阴茎的生长发育，在青春期由于阴茎头被包皮紧紧包住，得不到外界的应有兴奋，就会使阴茎头的发育受到很大束缚。性器官发育成熟后的阴茎头冠部的周径明显小，影响性性奋。这是男人包皮过长危害之一。
包皮过长会使阴茎发炎。讨厌的包皮垢正如各部位皮肤会分泌皮脂一样，包皮的皮脂腺也会分泌皮脂。由于包茎或包皮过长的包皮不能向上翻起，因此这些皮脂便积聚在包皮的内面与阴茎头之间的空隙中。同时，尿液也会渗入这个空隙，与这些皮脂发生化学反应，产生了奇臭的包皮垢。包皮垢适宜细菌生长，故可引起阴茎头及包皮发炎。病菌通过尿道还可以造成尿路感染。发生在尿道口的炎症，恢复后可引起尿道口狭小，造成排尿困难。
包皮过长会损害肾脏功能。由于阴茎发炎，可以引起尿道口或前尿道狭窄，造成排尿困难。而长期排尿困难，就会使肾脏的功能受到损害。
包皮过长有致疾病的危险。不少实验证实，包皮垢具有强烈的致疾病作用。包皮垢会造成一个阴茎头部恶劣的环境，可诱发许多阴茎疾病的疾病前不洁疾病变，例如阴茎角、阴茎乳头状瘤、、阴茎白斑、增殖性阴茎红斑症等，此类病变容易转化成阴茎疾病。刚开始，阴茎头部出现莫名其妙的肿块，不痛也不痒，但是不断地长大，长得宛如菜花状，突出在阴茎表面，也使阴茎变了模样。肿块表面还会溃烂，既臭又有许多分泌物。随着病情发展，附近的淋巴结增大，后疾病细胞转移至肝脏和肺里，生命受到威胁。
